بخش پاراکلینیک این بیمارستان همه امکانات تصویربرداری، تشخیصی و داروخانه را دارد.
به گفته علیرضا جلالی،رییس بیمارستان بقیه الله، اورژانس شیمیایی این بیمارستان در واقع یک بیمارستان کامل است که با 110 تخت بیمارستانی همه امکانات لازم برای خدمات رسانی به مصدومان شیمیایی، تصادفی و هسته ای را دارد.
وی افزود: برای ساخت این بیمارستان 8.5 میلیارد تومان هزینه شد که 1.5 میلیارد تومان آن را سپاه،2.5 میلیارد تومان آن را سازمان پدافند غیر عامل تامین کرده و 4.5 میلیارد تومان آن را بیمارستان بقیه الله تامین کرده است.
جلیلی در مراسم افتتاح اولین اورژانس شیمیایی کشور از خدمات رسانی بیمارستان بقیه الله به مصدومان مدافعان حرم از ملیتهای مختلف در نبرد با گروههای تکفیری خبر داد و گفت: طی 110 روز گذشته حدود 1600 نفر از مصدومان مدافعین حرم از ملیتهای مختلف پاکستان، افغانستان و عراق در این بیمارستان تحت درمان قرار گرفته اند.