براساس لایحه بودجه سال ۹۸ از میان دانشگاه های کشور، دانشگاه تهران بیشترین بودجه را به خود اختصاص داده و در میان ۱۳ دانشگاه برتر نیز دانشگاه خواجه نصیر کمترین بودجه را دارد.
محمدتقی نظر پور معاون اداری و مالی وزارت علوم نیز اعلام کرد که در مجموع در لایحه تقدیمی دولت به مجلس، بودجه دانشگاه های کشور در سال آینده حدود ۱۴ درصد افزایش یافته است.
| ردیف | نام دانشگاه | بودجه پیشنهادی ۹۸ |
| ۱ | تهران | ۱۱,۰۴۶,۷۷۹ |
| ۲ | شهید بهشتی | ۴,۱۷۴,۱۲۶ |
| ۳ | الزهرا | ۱,۵۳۸,۵۷۴ |
| ۴ | بین المللی امام خمینی(ره) | ۱,۲۰۵,۵۷۲ |
| ۵ | بوعلی سینا | ۱,۸۸۱,۲۰۱ |
| ۶ | ملایر | ۶۳۳,۵۹۹ |
| ۷ | سید جمال الدین اسدآبادی | ۹۵,۲۷۳ |
| ۸ | شیراز | ۳,۶۱۱,۱۷۳ |
| ۹ | سلمان فارسی | ۱۹۸,۹۹۵ |
| ۱۰ | صنعتی شیراز | ۵۷۷,۱۱۱ |
| ۱۱ | هنر شیراز | ۶۰,۷۰۴ |
| ۱۲ | فسا | ۱۷۶,۶۵۲ |
| ۱۳ | صنعتی اصفهان | ۲,۵۲۳,۹۶۸ |
| ۱۴ | شهرکرد | ۱,۳۶۸,۲۳۷ |
| ۱۵ | فردوسی مشهد | ۴,۰۸۴,۶۳۹ |
| ۱۶ | نیشابور | ۲۱۸,۸۶۵ |
| ۱۷ | صنعتی قوچان | ۲۹۴,۵۱۵ |
| ۱۸ | تربیت حیدریه | ۲۰۱,۹۹۳ |
| ۱۹ | صنعتی شریف | ۳,۸۷۱,۱۲۲ |
| ۲۰ | تبریز | ۳,۳۵۹,۴۰۹ |
ادامه جدول بودجه پیشنهادی دانشگاههای کشور در لایحه بودجه سال ۹۸ (مبالغ به میلیون ریال است)
| ردیف | نام دانشگاه | بودجه پیشنهادی ۹۸ |
| ۲۱ | بناب | ۳۲۴,۸۹۸ |
| ۲۲ | محقق اردبیلی | ۱,۵۴۷,۶۲۲ |
| ۲۳ | مراغه | ۴۷۱,۷۰۹ |
| ۲۴ | اصفهان | ۲,۷۵۳,۳۱۲ |
| ۲۵ | هنر اصفهان | ۴۹۹,۴۶۳ |
| ۲۶ | شهید چمران اهواز | ۲,۷۶۵,۳۳۰ |
| ۲۷ | صنعتی جندی شاپور | ۳۸۱,۷۴۹ |
| ۲۸ | صنعتی خاتم الانبیاء بهبهان | ۲۷۸,۴۷۲ |
| ۲۹ | صنعتی شهدای هویزه | ۶۰,۰۸۲ |
| ۳۰ | علوم و فنون دریایی خرمشهر | ۴۱۸,۳۶۳ |
| ۳۱ | رامین خوزستان | ۶۰۱,۰۳۲ |
| ۳۲ | گیلان | ۲,۲۴۱,۰۶۱ |
| ۳۳ | لرستان | ۱,۳۹۴,۴۶۸ |
| ۳۴ | شهید باهنر کرمان | ۲,۱۸۵,۰۹۳ |
| ۳۵ | صنعتی سیرجان | ۲۳۷,۴۹۶ |
| ۳۶ | جیرفت | ۳۴۲,۲۹۸ |
| ۳۷ | رازی | ۱,۹۵۸,۰۶۴ |
| ۳۸ | کردستان | ۱,۴۹۲,۹۷۶ |
| ۳۹ | علامه طباطبایی | ۲,۶۲۴,۷۹۶ |
| ۴۰ | سیستان و بلوچستان | ۲,۰۰۵,۷۶۲ |
ادامه جدول بودجه پیشنهادی دانشگاههای کشور در لایحه بودجه سال ۹۸ (مبالغ به میلیون ریال است)
| ردیف | نام دانشگاه | بودجه پیشنهادی ۹۸ |
| ۴۱ | زابل | ۱,۶۵۰,۵۱۶ |
| ۴۲ | دریانوردی و علوم دریایی چابهار | ۴۹۲,۸۴۵ |
| ۴۳ | مازندران | ۱,۶۲۰,۴۴۲ |
| ۴۴ | علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری | ۶۷۵,۱۴۷ |
| ۴۵ | صنعتی نوشیروانی بابل | ۷۴۷,۲۶۵ |
| ۴۶ | یزد | ۱,۸۲۳,۱۰۷ |
| ۴۷ | میبد | ۲۰۸,۰۰۰ |
| ۴۸ | اردکان | ۲۲۵,۴۹۶ |
| ۴۹ | هنر | ۶۸۸,۸۶۷ |
| ۵۰ | خوارزمی | ۲,۲۹۳,۸۸۲ |
| ۵۱ | کاشان | ۱,۲۵۴,۶۶۲ |
| ۵۲ | اراک | ۹۲۲,۴۹۰ |
| ۵۳ | حکیم سبزواری | ۸۷۷,۸۹۹ |
| ۵۴ | شاهد | ۲,۴۹۶,۰۷۰ |
| ۵۵ | صنعتی خواجه نصیر | ۱,۵۲۲,۲۶۱ |
| ۵۶ | دامغان | ۶۱۰,۵۵۷ |
| ۵۷ | تربیت مدرس | ۳,۶۳۳,۳۹۵ |
| ۵۸ | امیرکبیر | ۳,۲۵۲,۵۸۲ |
| ۵۹ | تفرش | ۲۴۴,۰۲۲ |
| ۶۰ | ارومیه | ۲,۲۸۷,۰۷۲ |
ادامه جدول بودجه پیشنهادی دانشگاههای کشور در لایحه بودجه سال ۹۸ (مبالغ به میلیون ریال است)
| ردیف | نام دانشگاه | بودجه پیشنهادی۹۸ |
| ۶۱ | ایلام | ۷۸۰,۰۲۸ |
| ۶۲ | صنعتی سهند | ۷۹۵,۴۳۱ |
| ۶۳ | هرمزگان | ۸۶۲,۹۲۲ |
| ۶۴ | هنر اسلامی تبریز | ۴۵۱,۶۷۴ |
| ۶۵ | علم و صنعت | ۲,۸۸۶,۵۹۷ |
| ۶۶ | اراک | ۱۸۱,۸۱۸ |
| ۶۷ | بیرجند | ۱,۵۹۷,۳۹۰ |
| ۶۸ | بزرگ مهر قائنات | ۱۳۳,۴۶۸ |
| ۶۹ | صنعتی بیرجند | ۱۹۱,۱۰۶ |
| ۷۰ | یاسوج | ۱,۰۵۸,۸۰۳ |
| ۷۱ | بجنورد | ۵۰۶,۳۹۳ |