جلیل گلشن، رئیس پژوهشگاه این سازمان با اعلام این خبر گفت: انتقال اسناد از 2 ماه قبل و با کتاب‌های مرکز اسناد و مدارک میراث فرهنگی آغاز شد و شبانگاه 22 مهر 92 با انتقال اسناد تاریخی باستان‌شناسی کشور به ساختمان مرکزی سازمان میراث فرهنگی، صنایع دستی و گردشگری در خیابان آزادی به پایان رسید.
وی هدف از این اقدام را الحاق مرکز اسناد و مدارک میراث فرهنگی به دیگر بخش‌های ستادی سازمان میراث فرهنگی در تهران و بهره‌برداری بهتر از آن‌ها اعلام کرد و گفت: انتقال اسناد از شیراز به تهران درهمه مراحل با اسکورت نیروی انتظامی همراه بود.
مرکز اسناد و مدارک سازمان میراث فرهنگی،صنایع دستی و گردشگری در سال1389 و در زمان ریاست حمید بقایی بر این سازمان در قالب آنچه طرح انتقال سازمان‌های دولتی از تهران به شهرستان‌ها خوانده می‌شد، از تهران به شیراز و تخت جمشید منتقل و با اعتراض کارشناسان و دوستداران میراث فرهنگی روبه‌رو شد. بویژه جامعه باستان‌شناسی کشور بر این باور بودند که اسناد در شرایط نامطلوبی نگهداری می‌شوند و آسیب‌های زیادی متوجه آن‌ها است. گلشن در این باره گفت: از آنجا که در زمان انتقال این اسناد در سازمان میراث فرهنگی نبودم، نمی‌توانم اظهارنظر دقیقی داشته باشم، اما در بازدیدی که از شیراز پس از تصدی ریاست پژوهشگاه داشتم، متوجه شدم بخشی از اسناد و مدارک در یک سوله نگهداری می‌شده که از نظر شرایط محیطی مانند نور، رطوبت، دما و عوامل تهدید‌کننده مانند باکتری‌ها، واجد شرایط مناسب نبوده است. رئیس پژوهشگاه میراث فرهنگی، صنایع دستی و گردشگری با اشاره به اخباری که درباره مفقود شدن بخشی از کتاب‌ها و اسناد در رسانه‌ها منتشر شده است، تأکید کرد: آنچه درباره مفقود شدن 47هزار کتاب گفته شده است، صحت ندارد؛ زیرا همه کتاب‌های موجود در مرکز اسناد و مدارک سازمان میراث فرهنگی معادل همین تعداد بوده است و نمی‌توان پذیرفت که کتاب‌ها یکجا مفقود شده باشند. با این حال به محض آن‌که فضای مناسب برای استقرار مرکز اسناد و مدارک در اختیار قرار بگیرد، تحقیق در این باره آغاز می‌شود و سازمان حتی نسبت به مفقود شدن چند نسخه کتاب یا چند برگ سند نیز حساسیت فراوان دارد. گلشن درباره ساماندهی کتاب‌ها و اسناد منتقل شده به تهران و احیای دوباره مرکز اسناد و مدارک سازمان میراث فرهنگی افزود: محل استقرار این مرکز که در گذشته در ساختمان مرکزی این سازمان قرار داشت، کاربری دیگری پیدا کرده و اکنون مهم‌ترین مشکل، یافتن جای مناسب برای نگهداری هزاران نسخه سند و کتاب و خدمات‌رسانی به پژوهشگران است. وی تأکید کرد:همه اسناد و کتاب‌ها پیش از انتقال، طبقه بندی شده و با توجه به موضوعیتی که دارند به تدریج تحویل کتابخانه مرکز سازمان میراث فرهنگی، پژوهشکده حفاظت و مرمت و پژوهشکده باستان‌شناسی خواهند شد.